| Pracovní číslo VÚ | ID vodního útvaru | Název vodního útvaru |
| D001 | DYJ_0010 | Moravská Dyje od pramene po tok Myslůvka |
| D002 | DYJ_0020 | Myslůvka od pramene po ústí do toku Moravská Dyje |
| D003 | DYJ_0030 | Řečice (Olšanský potok) od pramene po vzdutí nádrže Nová Říše |
| D004 | DYJ_0045_J | Nádrž Nová Říše na toku Řečice (Olšanský potok) |
| D005 | DYJ_0050 | Vápovka od pramene po ústí do toku Moravská Dyje, včetně toku Řečice (Olšanský potok) od hráze nádrže Nová Říše |
| D006 | DYJ_0060 | Bolíkovský potok od pramene po ústí do toku Moravská Dyje |
| D007 | DYJ_0070 | Moravská Dyje od toku Myslůvka po státní hranici |
| D008 | DYJ_0080 | Pstruhovec od pramene po státní hranici |
| D009 | DYJ_0090 | Slavonický potok od pramene po státní hranici |
| D010 | DYJ_0100 | Dyje od státní hranice po vzdutí nádrže Vranov, včetně toku Křeslický potok |
| D011 | DYJ_0110 | Želetavka od pramene po Manešovický potok |
| D012 | DYJ_0120 | Manešovický potok od pramene po ústí do toku Želetavka |
| D013 | DYJ_0130 | Bihanka od pramene po ústí do toku Želetavka |
| D014 | DYJ_0140 | Želetavka od Manešovického potoka po vzdutí nádrže Vranov |
| D015 | DYJ_0155_J | Nádrž Vranov na toku Dyje |
| D016 | DYJ_0160 | Dyje od hráze nádrže Vranov po státní hranici |
| D017 | DYJ_0170 | Dyje od státní hranice po vzdutí nádrže Znojmo |
| D018 | DYJ_0180 | Dyje od vzdutí nádrže Znojmo po státní hranici |
| D019 | DYJ_0185_J | Rybník Dolní Jaroslavický |
| D020 | DYJ_0190 | Dyje od státní hranice po státní hranici |
| D021 | DYJ_0200 | Dyje od státní hranice po vzdutí nádrže Nové Mlýny I.– horní |
| D022 | DYJ_0210 | Jevišovka od pramene po tok Ctidružický potok |
| D023 | DYJ_0220 | Ctidružický potok od pramene po ústí do toku Jevišovka |
| D024 | DYJ_0230 | Nedveka od pramene po ústí do toku Jevišovka |
| D025 | DYJ_0240 | Plenkovický potok od pramene po ústí do toku Jevišovka |
| D026 | DYJ_0250 | Křepička od pramene po ústí do toku Jevišovka |
| D027 | DYJ_0260 | Skalička od pramene po ústí do toku Jevišovka |
| D028 | DYJ_0270 | Jevišovka od toku Ctidružický potok po ústí do Dyje |
| D029 | DYJ_0295_J | Nádrž Nové Mlýny I. - horní na toku Dyje |
| D030 | DYJ_0300 | Svratka od pramene po Bílý potok |
| D031 | DYJ_0310 | Bílý potok od pramene po ústí do toku Svratka |
| D032 | DYJ_0320 | Fryšávka od pramene po ústí do toku Svratka |
| D033 | DYJ_0330 | Svratka od toku Bílý potok po vzdutí nádrže Vír I. |
| D034 | DYJ_0345_J | Nádrž Vír I na toku Svratka |
| D035 | DYJ_0350 | Bystřice od pramene po ústí do toku Svratka |
| D036 | DYJ_0360 | Hodonínka od pramene po ústí do toku Svratka |
| D037 | DYJ_0370 | Nedvědička od pramene po ústí do toku Svratka |
| D038 | DYJ_0380 | Svratka od hráze nádrže Vír I. po tok Bobrůvka (Loučka) |
| D039 | DYJ_0390 | Bobrůvka (Loučka) od pramene po tok Libochovka |
| D040 | DYJ_0400 | Libochovka od pramene po ústí do toku Bobrůvka (Loučka) |
| D041 | DYJ_0410 | Bobrůvka (Loučka) od toku Libochovka po ústí do toku Svratka |
| D042 | DYJ_0420 | Besének od pramene po ústí do toku Svratka |
| D043 | DYJ_0430 | Lubě od pramene po ústí do toku Svratka |
| D044 | DYJ_0440 | Bílý potok od pramene po ústí do toku Svratka |
| D045 | DYJ_0450 | Svratka od toku Bobrůvka (Loučka) po vzdutí nádrže Brno |
| D046 | DYJ_0460 | Kuřimka od pramene po vzdutí nádrže Brno |
| D047 | DYJ_0470 | Veverka od pramene po vzdutí nádrže Brno |
| D048 | DYJ_0485_J | Nádrž Brno na toku Svratka |
| D049 | DYJ_0490 | Svratka od hráze nádrže Brno po tok Svitava |
| D050 | DYJ_0500 | Svitava od pramene po tok Křetínka |
| D051 | DYJ_0510 | Křetínka od pramene po vzdutí nádrže Letovice |
| D052 | DYJ_0525_J | Nádrž Letovice na toku Křetínka |
| D053 | DYJ_0530 | Křetínka od hráze nádrže Letovice po ústí do toku Svitava |
| D054 | DYJ_0540 | Bělá od pramene po vzdutí nádrže Boskovice |
| D055 | DYJ_0550 | Okrouhlý potok od pramene po vzdutí nádrže Boskovice |
| D056 | DYJ_0565_J | Nádrž Boskovice na toku Bělá |
| D057 | DYJ_0570 | Bělá od hráze nádrže Boskovice po ústí do toku Svitava |
| D058 | DYJ_0580 | Býkovka od pramene po ústí do toku Svitava |
| D059 | DYJ_0590 | Svitava od toku Křetínka po tok Punkva |
| D060 | DYJ_0600 | Punkva od pramene po ponor |
| D061 | DYJ_0610 | Bílá voda od pramene po Marianínský potok včetně |
| D062 | DYJ_0620 | Punkva od ponoru po ústí do toku Svitava |
| D063 | DYJ_0630 | Šebrovka od pramene po ústí do toku Svitava |
| D064 | DYJ_0640 | Křtinský potok od pramene po ústí do toku Svitava |
| D065 | DYJ_0650 | Svitava od toku Punkva po ústí do toku Svratka |
| D066 | DYJ_0660 | Bobrava od pramene po ústí do toku Svratka |
| D067 | DYJ_0670 | Svratka od toku Svitava po tok Litava (Cézava) |
| D068 | DYJ_0680 | Litava (Cézava) od pramene po Litenčický potok včetně |
| D069 | DYJ_0690 | Hvězdlička od pramene po ústí do toku Litava (Cézava) |
| D070 | DYJ_0700 | Litava (Cézava) od toku Litenčický potok po Rakovec |
| D071 | DYJ_0710 | Rakovec od pramene po Vážanský potok včetně |
| D072 | DYJ_0720 | Rakovec od toku Vážanský potok po ústí do toku Litava (Cézava) |
| D073 | DYJ_0730 | Litava (Cézava) od toku Rakovec po tok Říčka (Zlatý potok) |
| D074 | DYJ_0740 | Říčka (Zlatý potok) od pramene po tok Roketnice |
| D075 | DYJ_0750 | Roketnice od pramene po ústí do toku Říčka (Zlatý potok) |
| D076 | DYJ_0760 | Říčka (Zlatý potok) od toku Roketnice po ústí do toku Litava (Cézava) |
| D077 | DYJ_0770 | Moutnický (Borkovanský) potok od pramene po ústí do toku Litava (Cézava) |
| D078 | DYJ_0780 | Litava (Cézava) od toku Říčka (Zlatý potok) po ústí do toku Svratka |
| D079 | DYJ_0790 | Šatava od pramene po ústí do toku Svratka |
| D080 | DYJ_0800 | Svratka od toku Litava (Cézava) po vzdutí nádrže Nové Mlýny II.- střední |
| D081 | DYJ_0810 | Jihlava od pramene po Třešťský potok |
| D082 | DYJ_0820 | Trešťský potok od pramene po ústí do toku Jihlava |
| D083 | DYJ_0830 | Maršovský potok od pramene po vzdutí nádrže Hubenov |
| D084 | DYJ_0845_J | Nádrž Hubenov na toku Maršovský potok |
| D085 | DYJ_0850 | Jihlava od toku Třešťský potok po tok Jihlávka, včetně toku Maršovský potok od hráze nádrže Hubenov |
| D086 | DYJ_0860 | Jihlávka od pramene po ústí do toku Jihlava |
| D087 | DYJ_0870 | Jihlava od toku Jihlávka po tok Brtnice |
| D088 | DYJ_0880 | Brtnice od pramene po ústí do toku Jihlava |
| D089 | DYJ_0890 | Stařečský potok od pramene po ústí do toku Jihlava |
| D090 | DYJ_0900 | Klapovský potok od pramene po ústí do toku Jihlava |
| D091 | DYJ_0910 | Mlýnský potok od pramene po ústí do toku Jihlava |
| D092 | DYJ_0920 | Jihlava od toku Brtnice po vzdutí nádrže Dalešice |
| D093 | DYJ_0935_J | Nádrž Dalešice na toku Jihlava |
| D094 | DYJ_0945_J | Nádrž Mohelno na toku Jihlava |
| D095 | DYJ_0950 | Jihlava od hráze nádrže Mohelno po tok Oslava |
| D096 | DYJ_0960 | Oslava od pramene po Bohdalovský potok |
| D097 | DYJ_0970 | Bohdalovský potok od pramene po ústí do toku Oslava |
| D098 | DYJ_0980 | Znětský potok od pramene po ústí do toku Oslava |
| D099 | DYJ_0990 | Oslava od toku Bohdalovský potok po vzdutí nádrže Mostiště |
| D100 | DYJ_1005_J | Nádrž Mostiště na toku Oslava |
| D101 | DYJ_1010 | Oslava od hráze nádrže Mostiště po tok Balinka |
| D102 | DYJ_1020 | Balinka od pramene po Lavičský potok |
| D103 | DYJ_1030 | Svatoslavský potok od pramene po ústí do toku Balinka |
| D104 | DYJ_1040 | Balinka od toku Lavičský potok včetně po ústí do toku Oslava |
| D105 | DYJ_1050 | Vodra od pramene po ústí do toku Oslava |
| D106 | DYJ_1060 | Polomina od pramene po ústí do toku Oslava |
| D107 | DYJ_1070 | Okarecký potok od pramene po ústí do toku Oslava |
| D108 | DYJ_1080 | Chvojnice od pramene po ústí do toku Oslava |
| D109 | DYJ_1090 | Balinka od pramene po ústí do toku Oslava |
| D110 | DYJ_1100 | Oslava od toku Balinka po ústí do toku Jihlava |
| D111 | DYJ_1110 | Rokytná od pramene po tok Rokytka |
| D112 | DYJ_1120 | Rokytka od pramene po Jakubovský potok včetně |
| D113 | DYJ_1130 | Štěpánovický potok od pramene po ústí do toku Rokytná |
| D114 | DYJ_1140 | Rokytná od toku Rokytka po tok Rouchovanka, včetně toku Rokytka od toku Jakubovský potok |
| D115 | DYJ_1150 | Rouchovanka od pramene po ústí do toku Rokytná |
| D116 | DYJ_1160 | Rokytná od toku Rouchovanka po ústí do toku Jihlava |
| D117 | DYJ_1170 | Olbramovický potok od pramene po vzdutí rybníka Novoveský |
| D118 | DYJ_1175_J | Rybník Novoveský na toku Olbramovický potok |
| D119 | DYJ_1180 | Jihlava od toku Oslava po vzdutí nádrže Nové Mlýny II.- střední |
| D120 | DYJ_1185_J | Rybník Starý |
| D121 | DYJ_1186_J | Rybník Vrkoč |
| D122 | DYJ_1195_J | Nádrž Nové Mlýny II. - střední na toku Dyje |
| D123 | DYJ_1205_J | Nádrž Nové Mlýny III. - dolní na toku Dyje |
| D124 | DYJ_1210 | Trkmanka od pramene po Spálený potok |
| D125 | DYJ_1220 | Spálený potok od pramene po ústí do toku Trkmanka |
| D126 | DYJ_1230 | Trkmanka od toku Spálený potok po ústí do toku Dyje |
| D127 | DYJ_1240 | Dyje od hráze nádrže Nové Mlýny III.- dolní po tok Odlehčovací rameno Dyje, Poštorná |
| D128 | DYJ_1250 | Včelínek (Sedlecký potok) od státní hranice po ústí do toku Odlehčovací rameno Dyje, Poštorná |
| D129 | DYJ_1255_J | Rybník Nesyt na toku Včelínek (Sedlecký potok) |
| D130 | DYJ_1260 | Dyje od toku Odlehčovací rameno Dyje, Poštorná po tok Kyjovka (Stupava) |
| D131 | DYJ_1270 | Kyjovka (Stupava) od pramene po tok Hruškovice |
| D132 | DYJ_1280 | Hruškovice od pramene po ústí do toku Kyjovka (Stupava) |
| D133 | DYJ_1290 | Kyjovka (Stupava) od toku Hruškovice po ústí do Dyje |
| D134 | DYJ_1300 | Dyje od toku Kyjovka (Stupava) po tok Morava |